En biología molecular, STRING (Herramienta de búsqueda para la recuperación de genes/proteínas que interactúan) es una base de datos biológica y un recurso web de interacciones proteína-proteína conocidas y previstas. … La última versión 11b contiene información sobre alrededor de 24, 5 millones de proteínas de más de 5000 organismos.
¿Cuál es el propósito de la base de datos STRING?
La base de datos STRING tiene como objetivo recopilar e integrar esta información mediante la consolidación de datos de asociación de proteínas conocidos y previstos para una gran cantidad de organismos.
¿Qué es una puntuación STRING?
En STRING, cada interacción proteína-proteína se anota con una o más "puntuaciones". Es importante destacar que estas puntuaciones no indican la fuerza o la especificidad de la interacción. En cambio, son indicadores de confianza, es decir, la probabilidad de que STRING juzgue que una interacción es verdadera, dada la evidencia disponible.
¿Por qué interactúan las proteínas?
Las interacciones proteína-proteína (PPI) son contactos físicos de alta especificidad establecidos entre dos o más moléculas de proteína como resultado de eventos bioquímicos dirigidos por interacciones que incluyen fuerzas electrostáticas, hidrógeno unión y el efecto hidrofóbico.
¿Qué es la asociación funcional?
definición. Relación binaria entre entidades biológicas cuando una de ellas modula a la otra en función, expresión, degradación o estabilidad de la otra y la relaciónentre los socios no puede determinarse como directo, por lo que los pasos intermedios están implícitamente presentes.
