Dado que la la sonicación puede potencialmente degradar las proteínas y desnaturalizar los epítopos de las proteínas, a continuación evaluamos el impacto de la sonicación en la integridad de las proteínas.
¿Puede la sonicación dañar las proteínas?
Respuestas populares (1)
Protocolo de sonicación estándar más bien no puede causar fragmentación de proteínas- la energía es demasiado baja. Ni siquiera debería provocar su desnaturalización. Puede desnaturalizarse cuando lo somete a ultrasonidos demasiado tiempo y sobrecalienta la muestra. Si usa cromatografía de níquel, otras bandas pueden ser simplemente impurezas.
¿Puede la sonicación romper los enlaces peptídicos?
La sonicación normalmente no puede romper la estructura primaria de una proteína porque esa estructura (la secuencia de aminoácidos) está construida con enlaces covalentes que son muchas veces más fuertes que los enlaces de hidrógeno y la sonicación puede proporcionar la energía necesaria para romper esos enlaces.
¿La sonicación rompe la membrana nuclear?
Una una sonicación corta con poca energía puede romper la membrana plasmática sin romper demasiadas membranas mitocondriales o nucleares y producir mitocondrias intactas.
¿Es necesaria la sonicación para la extracción de proteínas?
La solubilización con detergente (p. ej., SDS) que se requiere para el aislamiento de proteínas de membrana da como resultado un lisado similar al pegamento principalmente debido a los ácidos nucleicos. Por lo tanto, se requiere sonicación en tales casos para romper estos ácidos nucleicos. La sonicación genera mucho calor y no es buena paramuchas proteínas.